補發工資應按照工資、薪金所得專案計徵個人所得稅。工資、薪金所得應納的稅款，按月計徵，即，納稅人月初第一日至月末最後一日，取得的工資、薪金所得，減除費用5000元后，依法計徵個人所得稅。
也就是說調資後補發以前數月的工資，可以分推到所屬月份，與原來的月工資合併計算應繳個人所得稅，扣除已繳納的個人所得稅，即為應該補繳的稅款。
《工資支付暫行規定》
第四條 工資支付主要包括：工資支付專案、工資支付水平、工資支付形式、工資支付物件、工資支付時間以及特殊情況下的工資支付。
第五條 工資應當以法定貨幣支付。不得以實物及有價證券替代貨幣支付。
第六條 用人單位應將工資支付給勞動者本人。勞動者本人因故不能領取工資時，可由其親屬或委託他人代領。
用人單位可委託銀行代發工資。
用人單位必須書面記錄支付勞動者工資的數額、時間、領取者的姓名以及簽字，並儲存兩年以上備查。用人單位在支付工資時應向勞動者提供一份其個人的工資清單。
