性質屬性差別：不動產證的出現源於不動產登記制度的建立，同時也是為了日後頒佈房產稅制度奠定基礎。雖然在一定程度上房產證是一個很重要的證件，但不動產證是“三證合一”的產物，法律效益更高一些。不動產證可以被視為新版房產證，但房產證卻不能被視為舊版不動產證。
頒發機構差別：房產證是由住房和城鄉建設部所發放的，而不動產證是由國土資源部所頒發的。
資訊內容區別：不動產登記證是房產證和土地使用權二合一的證書，上面不僅有房產證上該有的基本資訊外，還有像宅基地等資訊。因此，在有不動產登記證的情況下，房產證則變成了一個“附屬品”。
“紅證”、“綠證”、“黃證”有什麼特殊意義嗎?
紅色：房產所有權和土地所有權合一的證，(商品房，可自由交易)
綠色：土地性質為國有的房地產權證，分為國有出讓和國有劃撥兩種土地性質。(出讓性質的可以正常交易，劃撥性質的必須在補繳土地出讓金後，轉為出讓性質才能正常交易)
黃色：紅綠證用地情況之外的房地產權證，比如以徵用劃撥方式取得土地使用權、職工購買的平價房、優惠價房等情況。
最早的時候，證件劃分比較考究，不過後來因為各地區發展和改革，就簡化了。因此，顏色也不一定代表什麼了，基本上同一地區的房屋證件顏色是統一的，以紅色為主，綠色有之，黃色已經很少見了。
