土地經營權糾紛解決的依據主要有《中華人民共和國土地管理法》對土地權屬糾紛的解決途徑進行明確的規定，先行協商解決，協商不成的，由人民政府處理。當事人對有關人民政府的處理決定不服的，可以自接到處理決定通知之日起三十日內，向人民法院起訴。
《中華人民共和國農村土地承包法》規定農村土地承包經營權流轉糾紛的處理途徑，因土地承包經營發生糾紛的，雙方當事人可以通過協商解決，也可以請求村民委員會、鄉(鎮)人民政府等調解解決。調解或者協商不成的，可以向農村土地承包仲裁機構申請仲裁，也可以直接向人民法院起訴。
如果是土地經營權的權屬發生糾紛，管轄部門為國土部門、縣級以上政府、有管轄權的法院。按照《土地管理法》的規定，先行由縣級國土部門調查、調解，如果能協商解決是最佳的解決辦法，可以解決定紛止爭，節省人財物力，協商不成的，由縣級政府進行裁決，對政府裁決不服的，可以向人民法院起訴解決。
法律依據：
《中華人民共和國農村土地承包法》第五十一條
因土地承包經營發生糾紛的，雙方當事人可以通過協商解決，也可以請求村民委員會、鄉（鎮）人民政府等調解解決。
當事人不願協商、調解或者協商、調解不成的，可以向農村土地承包仲裁機構申請仲裁，也可以直接向人民法院起訴。
第五十二條
當事人對農村土地承包仲裁機構的仲裁裁決不服的，可以在收到裁決書之日起三十日內向人民法院起訴。逾期不起訴的，裁決書即發生法律效力。
