勞動仲裁管轄的是勞動爭議，如果工程施工糾紛涉及到勞動爭議的，可以申請勞動仲裁，如果是工程問題產生糾紛的，不適用勞動仲裁。
根據《勞動爭議調解仲裁法》規定：
第二條中華人民共和國境內的用人單位與勞動者發生的下列勞動爭議，適用本法：
(一)因確認勞動關係發生的爭議;
(二)因訂立、履行、變更、解除和終止勞動合同發生的爭議;
(三)因除名、辭退和辭職、離職發生的爭議;
(四)因工作時間、休息休假、社會保險、福利、培訓以及勞動保護髮生的爭議;
(五)因勞動報酬、工傷醫療費、經濟補償或者賠償金等發生的爭議;
(六)法律、法規規定的其他勞動爭議。
