1.智慧財產權共有的效力。智慧財產權共有的效力及於客體的全部，而不是份額。《日本民法典》第249條規定：“各共有人，可以按其共有部分，使用全部共有物。”知識財產的利用，並不需要對物質實體的佔有，這為共有人自由獨立地使用共有知識財產提供了可能。因此，智慧財產權共有人的權利效力與共有人所持份額無關。在沒有合同特別約定的情況下，共有人使用共有知識財產不必徵得其他共有人同意。但是，由於著作權的行使與權利人的人格利益有著密切聯絡，所以《日本著作權法》第65條第27項規定，著作權共有利用作品應徵得各個共有人的同意。但該條第3項和第4項同時也規定，共有人沒有正當理由不得拒絕整體同意，如在1人反對的情況下，不能妨礙合意的成立，並且可以為權利的行使而設立代表人。
在智慧財產權共有的權利行使方面，智慧財產權共有人可自行實施知識財產，不必徵得其他共有人的同意，但是智慧財產權共有人為份額轉讓、權利轉讓、利用知識財產進行擔保和進行許可等行為的，須徵得其他共有人的同意。為了便於權利的行使，日本智慧財產權法，如著作權法、專利法等均主張設立代表人制度，由選定的代表人決定權利是否可以行使。
2.智慧財產權共有的法律適用。智慧財產權共有的法律適用的一般規則為：智慧財產權法有特別規定的，適用智慧財產權法的特別規定;智慧財產權法無特別規定的，適用民法物權編關於共有的規定。鑑於智慧財產權法與公共利益的密切關係，對共有往往有特別的規定。當智慧財產權法對智慧財產權的共有有特別規定的時候，優先適用這些規定。《日本民法典》第264條規定了所有權以外的財產權的共有及其法律適用。該條規定：“本節規定，準用於數人有所有權以外的財產權情形。”
