房屋建設工程施工合同糾紛處理方式可以通過和解、或者是調解、以及還有仲裁方式;如果前面三種都處理不好的話，那麼也是可以通過訴訟的方式來進行解決雙方的糾紛，這都是可以得到法律支援的。
1、和解。和解是當事人因合同發生糾紛時可以再行協商，在尊重雙方利益的基礎上，就爭議的事項達成一致，從而解決糾紛的方式。和解是當事人自由選擇的在自願原則下解決臺同糾紛的方式，而不是合同糾紛解決的必經程式。當事人也可以不經協商和解而直接選擇其他解決糾紛的途徑。
2、調解。凋解是在第三人的主持下，通過運用說服教育等方法來解決當事人之間的合同糾紛。調解有兩種方式一是人民調解委員會調解當事人發生合同糾紛，可以向糾紛當事人所在地或者糾紛發生地的人民調解委員會申請調解。二是行政調解。主要特指工商行政管理機關居中對合同當事人的糾紛進行調解。
申請行政調解的糾紛必須具備以下條件：申請人必須是與本案有直接利害關係的當事人，有明確的被申請人、具體的調解請求和事實根據;符合工商行政管理機關受理案件範圍的規定。但已經向人民法院起訴的或者已經向仲裁機構申請裁的。從及一方要求調解另一方不同意調解的，調解申請不於受理。
3、仲裁。仲裁是發生合同爭議的雙方當事人，根據爭議發生前或發生後達成的仲裁協議，將糾紛提交仲裁機關進行裁決並解決糾紛的方式。仲裁具有“準司法”性質，仲裁機構作出的仲裁裁決具有法律效力，當事人應當履行。
4、訴訟。訴訟是合同糾紛發生後，當事人如果沒有仲裁協議，任何一方均可以向人民法院提起民事訴訟，請求人民法院對合同糾紛依法予以處理。這是解決合同糾紛的最常見方式。合同糾紛經人民法院審理並作出判決後，當事人對人民法院作出的發生法律效力的判決書，調解書必須履行，拒不履行的，另一方當事人可以申請人民法院強制執行。
在日常的施工合同的履行中，如果是因合同出現了糾紛，那麼就需要雙方以合適的方式來進行處理，一般在處理時就可以運用和解、調解、仲裁、訴訟;但不管是運用哪一種都需要有合法的證明材料，而且還要確保自己的權利和利益不會受到任何的損害。
