一、合同是總公司籤付款由分公司付是否合理?
合同是總公司籤付款由分公司付的操作是合理的，總公司與分公司的關係：
1、分公司是與總公司或本公司相對應的一個概念。許多大型企業的業務分佈於全國各地甚至許多國家，直接從事這些業務的是公司所設定的分支機構或附屬機構，這些分支機構或附屬機構就是所謂的分公司。而公司本身則稱之為總公司或本公司。
2、分公司是總公司下屬的直接從事業務經營活動的分支機構或附屬機構。雖然分公司有公司字樣，但它不是真正意義上的公司。因為分公司不具有企業法人資格，不具有獨立的法律地位，不獨立承擔民事責任。
3、分公司沒有自己的獨立財產，其實際佔有、使用的財產是總公司財產的一部分，列入總公司的資產負債表中。
二、設立分公司的具體條件
1、公司的登記事項包括：名稱、營業場所、負責人、經營範圍。並且分公司的名稱應符合國家有關規定，分公司的經營範圍不得超出公司的經營範圍。
2、應當自決定作出之日起30日內向公司登記機關申請登記，法律、行政法規規定必須報經有關部門審批的，應當自批准之日起30日內向公司登記機關申請登記。
3、登記應提交下列檔案：首先，公司法定代表人簽署的設立分公司的登記申請書。其次，公司章程以及由公司的公司登記機關加蓋印章的《企業法人營業執照》影印件。另外，營業場所使用證明。最後，公司登記機關要求提交的其他檔案。分公司不具有法人資格，其資產不能承擔責任時最終應總公司來承擔。
三、分公司的主要特點有：
1、分公司是由隸屬公司依法設立的;
2、分公司沒有自己獨立的財產，與隸屬公司在經濟是統一核算，其在經營活動中的負債由隸屬公司負責清償;
3、分公司不獨立承擔民事責任，沒有自己的章程，沒有董事會等形式的公司經營決策和業務執行機關;
4、分公司沒有獨立的名稱，其名稱只要在總公司名稱後加上分公司字樣即可。
《公司法》第十四條 分公司與子公司
公司可以設立分公司。設立分公司，應當向公司登記機關申請登記，領取營業執照。分公司不具有法人資格，其民事責任由公司承擔。公司可以設立子公司，子公司具有法人資格，依法獨立承擔民事責任。
綜上所述，本來分公司所有的資產就是來源於總公司，所以總公司要求分公司付款也沒有什麼不合理的，在財務上的具體管理模式可以由總公司自行制定。假如說目的是為了避稅的話，那在整個付款的過程中一定要注意賬戶上的記載，避稅也要合理進行。
