農村自建房轉讓協議可以公證嗎

不可以。農村宅基地屬於農民集體所有。
《土地法》第九條規定：城市市區的土地屬於國家所有。農村和城市郊區的土地，除由法律規定屬於國家所有的以外，屬於農民集體所有;宅基地和自留地、自留山，屬於農民集體所有。