1、貸款利率不同
公積金貸款：4.5%
商業貸款：6.55%
2、審批速度不同
商業貸款比公積金貸款要快很多，商業貸款在借款人簽訂購房合同後，直接到相關銀行經辦機構或與銀行簽訂合作協議的開發商處提供有關材料即可辦理。
3、用途不同
商業貸款可以用來買住宅、商住。公積金貸款只能用於買住宅、裝修等。
4、貸款額度不同
一般來講，普通購房者在辦理商貸時，除自身收入情況會影響到貸款額度外，商業銀行的住房貸款額度上限足夠用，而公積金受繳納人群及地區特點，對個人及家庭貸款額度是有所限制的。
法律依據：
《住房公積金管理條例》第二十七條申請人申請住房公積金貸款的，應當提供擔保。
