1、兩者的賠償主體不同。
國家賠償的主體是國家，即國家是賠償責任的承擔者，但具體的賠償義務由法定賠償義務機關履行；民事賠償的主體是民事主體，賠償主體與賠償義務人是一致的。
2、兩種賠償發生的基礎不同。
國家賠償發生在國家權力的動作過程中，由國家侵權行為引起；而民事賠償則由發事侵權行為引起，發生在民事活動中，與公共權力的動作無關。
3、兩種賠償的歸責原則不同。
國家賠償的歸責原則主要是違法原則；而民事賠償的歸責原則主要是過錯原則。
4、兩種賠償的程式不同。
在提起國家賠償訴訟之前，除在行政訴訟中附帶提起賠償外，請求人應先向賠償義務機關提出賠償請求，即實行賠償義務的機關決定前置原則，不經該決定程式，法院不予受理；而民事賠償中，受害人可以直接向法院提起賠償請求，無需經過任何前置程式。
5、兩者的賠償範圍不同。
國家賠償主要限於物質損害的賠償，精神損害原則上不予賠償，對物質損害的賠償以直接損失為限，不包括間接損失；而民事賠償既包括對物損害的賠償，也包括對精神損害的賠償，對物質損害的賠償不以直接損失為限，也包括間接損失。
6、兩者的賠償方式不同。
國家賠償以支付賠償金為主要賠償方式；而民事賠償既可以採取金錢賠償方式，也可以採取恢復原狀等方式。
【法律依據】
《民法典》第一百七十九條
承擔民事責任的方式主要有：
（一）停止侵害；
（二）排除妨礙；
（三）消除危險；
（四）返還財產；
（五）恢復原狀；
（六）修理、重作、更換；
（七）繼續履行；
（八）賠償損失；
（九）支付違約金；
（十）消除影響、恢復名譽；
（十一）賠禮道歉。
法律規定懲罰性賠償的，依照其規定。
本條規定的承擔民事責任的方式，可以單獨適用，也可以合併適用。
