自2014年6月1日起，從事第二類醫療器械經營的，經營企業應填寫第二類醫療器械經營備案表，向所在地設區的市級食品藥品監督管理部門備案，並提交符合第二類醫療器械經營備案材料要求的備案材料。
接收醫療器械經營備案材料的設區的市級食品藥品監督管理部門應當場對備案材料完整性進行核對，符合規定條件的予以備案，發給第二類醫療器械經營備案憑證）。
第二類醫療器械經營備案憑證的備案號編號規則為：__食藥監械經營備________號。其中：第一位_代表備案部門所在地省、自治區、直轄市的中文簡稱，第二位_代表所在地設區的市級行政區域的中文簡稱，第三到六位_代表4位數備案年份，第七到十位_代表4位數備案流水號。[1]
2014年6月1日前已取得第二類醫療器械經營許可的，不需重新辦理備案。經營許可證到期需繼續從事經營的，應辦理備案。
法律依據：
《醫療器械監督管理辦法》第六十四條
《醫療器械經營許可證》和醫療器械經營備案憑證的格式由國家食品藥品監督管理總局統一制定。
《醫療器械經營許可證》和醫療器械經營備案憑證由設區的市級食品藥品監督管理部門印製。
《醫療器械經營許可證》編號的編排方式為：__食藥監械經營許________號。其中：
第一位_代表許可部門所在地省、自治區、直轄市的簡稱;
第二位_代表所在地設區的市級行政區域的簡稱;
第三到六位_代表4位數許可年份;
第七到十位_代表4位數許可流水號。
第二類醫療器械經營備案憑證備案編號的編排方式為：__食藥監械經營備________號。其中：
第一位_代表備案部門所在地省、自治區、直轄市的簡稱;
第二位_代表所在地設區的市級行政區域的簡稱;
第三到六位_代表4位數備案年份;
第七到十位_代表4位數備案流水號。
