1、作為懲戒方式，它們的類別、審批時效不同。開除是屬於行政處分，而且是最嚴厲的一種處分。其處理時效為：從證實職工犯錯誤之日起5個月之內審批完畢。違紀辭退屬於行政處理，不屬行政處分之列。因此對它們沒有具體的審批時效規定，但原則要求應對犯錯誤職工及時進行處理，不得無故拖延處理時間。
2、作為懲戒方式，它們的適用物件及其條件不同。開除處分適用於嚴重違法亂紀的職工，主要包括以下幾種情況：
①被判刑併入監服刑的;
②二次勞教被登出城市戶口的;
③留用察看期間表現仍不好的;
④嚴重犯有《企業職工獎懲條例》第十一條所列七項錯誤行為之一的。
違紀辭退則適用於犯有《國營企業辭退違紀職工暫行規定》第二條所列七項錯誤行為之一，且經教育或行政處分無效的職工。一般是指那些大錯不犯、小錯不斷的職工，他們所犯錯誤程式既夠不上開除、也夠不上除名。
3、作為懲戒方式，它們的實施程式不同。開除處分，按《企業職工獎懲條例》規定，應由廠長或者經理提出，由職工代表大會討論決定。違紀辭退，按照《國營企業辭退違紀職工暫行規定》，應由車間、科室提出職工違紀的證據和處理意見，在聽取工會意見後，由廠長(經理)決定予以辭退。
