一、工程結算超過合同金額怎麼辦
當事人在建設工程施工合同專用條款或另行簽訂的協議中明確約定發包人應在收到承包人提交竣工結算檔案後一定期限內予以答覆，且逾期未答覆則視為認可竣工結算檔案的，承包人依據《建工司法解釋》第二十條的規定請求按照竣工結算檔案結算工程價款的，應予支援。
沒有明確約定逾期未答覆則視為認可竣工結算檔案的，承包人請求按照竣工結算檔案確定工程價款的，不予支援。
二、工程造價出現超預算原因
1、設計變更的原因：設計變更導致實際工程量大於清單工程量，工程量超過合同約定的浮動範圍，依據合同的約定，可以辦理簽證追加超出部分的工程量價款，會造成工程結算價款的增加。
2、招標工程量清單漏項的原因：如果在招標工程量清單中有漏項的部分，也會導致在施工過程中，要補充遺漏的清單專案，勢必造成工程價款的增加。
3、材料價格的上漲原因：如果施工當期的主材價款漲價超過了合同約定的浮動範圍，依據合同，在中間支付價款要調整材料的單價，也會造成結算價款的增加。
4、規費的調整原因：在施工當期，建設或財政主管部門出臺的關於工程繳納規費的政策調整，如果在合同有約定要調整的，也會影響到結算價款的調整。
特別要注意的是，工程造價超過預算，指的是工程結算價款大於預算。所以要求造價人員在編制招標控制價時，要有前瞻性，要考慮一定的風險因素，對於不能確定的價款要多開展詢價工作，做到不漏項，不漏算，預算要儘可能的真實反映工程的實際造價。
三、建築工程結算流程注意事項
1、核對與編制好結算資料基礎。 任何一個工程專案，在編制結算時都要以相關資料依為依據。
2、工程量是稽核的關鍵。 工程量費用是工程造價的主體。運作中具有較大的彈性和隱蔽性。稽核工程量是重點，也是難點。
3、定額單價的稽核不可忽視。在一般情況下，工程的定額單價都有具體規定，編制工程結算時只要參照定額單價的明細子目直接就可以套用。然而在實際操作中，定額單價套用往往出現差錯。
4、其他費用的稽核堅持合情合理。 其他費用，由於計算方法不同於工程量和定額單價的套用，故在稽核中要根據費用的發生具體對待。
