我國《土地管理法》中對房屋用地糾紛的解決辦法，主要有三種：
1、協商解決。《土地管理法》第16條第1款規定：“土地所有權和使用權爭議，由當事人協商解決。”據此規定，公民之間發生的房屋用地糾紛，應當先通過協商的方式加以解決。
2、行政解決。《土地管理法》第16條第2款規定：“個人之間，個人與單位之間爭議，由鄉級人民政府或者縣級以上人民政府處理。”該法還規定，侵犯土地的所有權或者使用權爭議，由縣級以上地方人民政府土地管理部門責令停止侵犯、賠償損失。
3、司法解決。《土地管理法》第16條第2款規定：“當事人對有關人民政府的處理決定不服的，可以在接到處理決定通知之日起三十日內，向人民法院起訴。”這表明公民之間就土地的使用權和所有權發生的糾紛，只與按照《土地管理法》第16條和第53條的規定，先經過有關行政機關的處理，對於處理決定不服，才可以向人民法院提起訴訟。
4、房屋用地糾紛還可以通過人民調解來解決。
