不同動產的抵押登記機關有：
1、企業裝置、原輔材料、產品或商品等，工商部門，《企業動產抵押物登記管理辦法》;
2、非農用機動車，車輛管理局，《機動車登記辦法》;
3、農用機器裝置，農機站;
4、農作物和其他農業收穫物，農業局;
5、果園、樹林，林業局;
6、船舶《海商法》所指，海事局《海商法》、《船舶登記條例》;
7、漁業船舶，漁政漁港監督管理局，《漁業船舶登記辦法》;
8、民用航空器，民用航空管理部門，《民用航空法》。
【法律依據】《民法典》第四百零三條 以動產抵押的，抵押權自抵押合同生效時設立;未經登記，不得對抗善意第三人。
