北京醫療事故的鑑定流程主要是醫患雙方協商一致，共同向市醫學會提起鑑定申請，由醫學會受理鑑定，由申請一方或者雙方交納鑑定費用，醫學會通知醫患雙方提交陳述書，答辯書及醫療事故鑑定所需要的材料，組成專家組進行鑑定，專家組討論，最後出具鑑定結論報告。
1、過錯責任原則
是指以行為人主觀上有過錯為承擔民事責任的充要條件，即行為人僅在有過錯的情況下，才承擔民事責任，沒有過錯就不承擔民事責任。在過錯責任下，對侵權行為實行“誰主張，誰舉證”的原則。受害人有義務舉出相應證據表明加害人主觀上有過錯，以保障其主張得到支援。加害人過錯的程度在一定程度上也會對其賠償責任的範圍產生影響。
推定過錯責任，是指行為人致人損害時，如果不能證明自己沒有過錯，就要推定其有過錯，並承擔侵權責任。推定過錯責任，仍以過錯作為承擔責任的基礎，因而它並不是一項獨立的歸責原則，只是過錯責任原則的一種特殊方式。對這類侵權行為，舉證責任的分配一般採取“舉證責任倒置”，但採用這一原則時，只能適用於法律有特別規定的情形。
根據最高人民法院公佈的《關於民事訴訟證據的若干規定》第四條第八項規定：“因醫療行為引起的侵權訴訟，由醫療機構就醫療行為與損害結果之間不存在因果關係以及不存在過錯承擔舉證責任。”這就強調醫療事故的侵權責任採取過錯推定責任，但允許醫療機構通過舉證證明其不存在醫療過錯，從而免責。這一舉證責任規定並非將按照一般分配原則分配給當事人的證明責任全部加以倒置，而是根據具體情況對某些事實的證明責任予以倒置，關於損害事實的證明就沒有倒置，仍然有受損害的一方加以證明。
2、無過錯責任原則
是指損害發生後，不以行為人的主觀過錯為責任要件的歸責標準，即不因行為人主觀上有無過錯，只要行為人的行為和所管理的人或物與造成的損害後果之間有因果關係，他就應承擔民事責任。同樣無過錯責任原則僅適用於法律特別規定的場合。
3、公平責任原則
是指當事人雙方對損害的發生均無過錯，法律又無特別規定適用無過錯責任原則時，由人民法院根據公平的觀念，在考慮當事人雙方的財產情況及其他情況的基礎上，責令加害人對受害人的財產損害給予適當補償，由當事人公平合理地分擔損失的一種歸責原則。在輸血後意外感染丙肝的案件審理中，在採供血機構和臨床用血的醫療機構不存在過錯的前提下，人民法院根據公平原則判令採供血機構對受害人進行一定的經濟補償，採供血機構通過責任保險來由保險公司分擔其責任。但也有一些省市的人民法院在審理此類案件中，因為採供血機構或者臨床用血機構存在過錯或是不能舉證證明其沒有過錯，而判令鉅額賠償。
任何地方醫療事故鑑定的流程都是如此的。不過，提起醫療事故鑑定的可以是醫患雙方，也可以是患者、也可以是法院指定事故鑑定機構。在各方人員提交了醫療事故鑑定需要的材料之後，後續的醫療事故的鑑定流程就不是任何人可以左右的了，工作人員會按照國家規定的流程開展鑑定工作。
