繳費週期：職工醫保是按月繳費，新農保按年繳費。
繳費金額：職工醫保是按照參保人繳費基數核算月繳費額，所以個體間是有較大差異的;但新農保繳費金額是一樣的。
繳費主體：職工醫保是個人和所在企業;新農保是個人和當地政府。
報銷比例：各地間報銷比例有差異，但同一地間此二者報銷比例也不相同。
醫保指社會醫療保險。社會醫療保險是國家和社會根據一定的法律法規，為向保障範圍內的勞動者提供患病時基本醫療需求保障而建立的社會保險制度。基本醫療保險基金由統籌基金和個人賬戶構成。職工個人繳納的基本醫療保險費全部計入個人賬戶;用人單位繳納的基本醫療保險費分為兩部分，一部分劃入個人賬戶，一部分用於建立統籌基金。
