農民工工資也是按照個人所得稅法的要求繳稅，即工資超過5000以上需繳納個人所得稅，可以由單位的扣繳義務人代為扣稅，其中養老支出、子女教育等、大病醫療、住房貸款利息或者住房租金費用是可以作為抵扣稅務的專案。
法律依據：《工資支付暫行規定》
第四條 工資支付主要包括：工資支付專案、工資支付水平、工資支付形式、工資支付物件、工資支付時間以及特殊情況下的工資支付。
第五條 工資應當以法定貨幣支付。不得以實物及有價證券替代貨幣支付。
第六條 用人單位應將工資支付給勞動者本人。勞動者本人因故不能領取工資時，可由其親屬或委託他人代領。
用人單位可委託銀行代發工資。
用人單位必須書面記錄支付勞動者工資的數額、時間、領取者的姓名以及簽字，並儲存兩年以上備查。用人單位在支付工資時應向勞動者提供一份其個人的工資清單。
