不能的。因為廠房是歸屬於公司所有的，即便是公司沒有按照法律規定給與員工賠償，員工也沒有權利私下出售公司的廠房，而且廠房的出售是需要有產權的，員工沒有相應的產權，自然也無法出售。
法律依據:《中華人民共和國城市房地產管理法》第三十八條下列房地產，不得轉讓：
（一）以出讓方式取得土地使用權的，不符合本法第三十九條規定的條件的；
（二）司法機關和行政機關依法裁定、決定查封或者以其他形式限制房地產權利的；
（三）依法收回土地使用權的；
（四）共有房地產，未經其他共有人書面同意的；
（五）權屬有爭議的；
（六）未依法登記領取權屬證書的；
（七）法律、行政法規規定禁止轉讓的其他情形。
