新三板公司併購流程：明確併購動機與目的→制定併購戰略→成立併購小組→選擇併購顧問→尋找和確定併購目標→聘請法律和稅務顧問→與目標公司股東接洽→簽訂意向書→制定併購後對目標公司的業務整合計劃→開展盡職調查→談判和起草併購協議→簽約、成交。
法律依據：《非上市公眾公司收購管理辦法》 第六條
收購人及其實際控制人應當具有良好的誠信記錄，收購人及其實際控制人為法人的，應當具有健全的公司治理機制，不得利用公眾公司收購損害被收購公司及其股東的合法權益。有下列情形之一的，不得收購公眾公司：① 收購人負有數額較大債務，到期未清償，且處於持續狀態；② 收購人最近2年有重大違法行為或者涉嫌有重大違法行為；③ 收購人最近2年有嚴重的證券市場失信行為；⑤ 收購人為自然人的，存在《公司法》第一百四十六條規定的情形；⑥ 法律、行政法規規定以及中國證監會認定的不得收購公眾公司的其他情形。
