股權轉讓協議無效的處理方式是：
1、轉讓人需要向受讓人返還轉讓的價款，受讓人需要向轉讓人返還股權。
2、有過錯的當事人還要根據本人的過錯程度，向對方承擔賠償責任。
3、各方都有過錯的，應當各自承擔相應的責任。
法律依據：
《中華人民共和國民法典》第一百五十七條
民事法律行為無效、被撤銷或者確定不發生效力後，行為人因該行為取得的財產，應當予以返還；不能返還或者沒有必要返還的，應當折價補償。有過錯的一方應當賠償對方由此所受到的損失；各方都有過錯的，應當各自承擔相應的責任。法律另有規定的，依照其規定。
