購房合同上標註的面積與房產證上標註的面積有差異是正常的，但是其差異值要控制在一定的範圍。那如果購房合同面積與房產證面積不一樣怎麼辦呢?一般誤差值在3%以內，按多退少補原則處理。誤差值超過3%，超過的面積開發商贈與，不足的面積開發商要雙倍補償，購房者也可以選擇退房。
面積出入糾紛是指房產商交給購房者房屋實際實用面積與合同不符，發生建築面積的增加或減少，因損害購房者利益而引發的糾紛。
以下幾種情況極易引起面積出入糾紛：
一是應付購房款不變，總建築面積、套內面積、公攤面積同比減少。此時，房產商或者隱瞞建築面積減少的事實，或者在不能隱瞞時，拒絕購房者的退房退款要求，或者在購房者未要求退房時拒絕返還面積減少部分的房價款;
二是公攤面積不變，總建築面積、套內面積減少，房產商拒絕返還減少部分的房價款;
三是總建築面積不變，套內面積減少，公攤面積增加;
四是套內面積不變，總建築面積、公攤面積增加;
五是套內面積減少，總建築面積增加、公攤面積增加(第三、四、五等三種情況也是引起公攤面積糾紛的原因);
六是總建築面積、套內面積、公攤面積同比增加。在出現第四、五、六三種情況時，房產商不問青紅皁白，強行要求購房者補足增加部分的房價款，從而引發糾紛。
七是當房屋面積存在出入時，在誤差面積對應價款的處理上產生糾紛。
當面積糾紛產生後，在確定解決爭議的方法上產生新的糾紛。購房合同中，購房者較容易忽略“解決爭議的方法”條款，對該條款常常未予約定或約定不明。以致合同糾紛產生後，當事人之間在選擇爭議解訣方法上又發生新的糾紛。目時，也由於房屋面積管理政出多門，在應由哪個部門裁決面積糾紛的問題上，購房者無所適從。
按照規定，房屋實測面積誤差在3%以內的按多退少補的原則來處理。
房屋面積大於合同面積的，由業主補償開發商購房款，房屋面積小於合同面積的，開發商退回相應面積的購房款。如果誤差超過3%。房屋面積大於合同面積的，3%以內的有購房人補齊，超過3%的部分算開發方式贈與;房屋面積小於合同面積，按3%的面積核算後退回相應房款，超過3%的部分，需雙倍退款。當然這種情況下，購房者也可選擇解除購房合同，並要求開發商返還已付房款及利息。房屋的面積影響到很多問題，比如契稅，它是以實測房產證面積為準繳納的。辦理兩證時需要提交購房發票和房產證，兩者不一致時以房產證為準。當購房合同面積與房產證面積有差異時，購房者有權利用法律武器維護自己的合法權益，且差異較大時，購房者有權退回所購房產，開發商應該無條件退回，並且退回所收取的房款，還要支付產生的利息。
