軟體著作權作為重要的登記手續，一般都需要通過一系列的流程，一般都要準備相關申請表與個人身份證件。
軟體著作權登記申請有兩種方式：
一是自行向中國版權保護中心提出申請。
二是委託專業代理機構代為提交申請。軟體著作權登記申請的檔案多而雜，往往容易出現錯誤或者表達不一致的情況，而專業代理機構(木子版權代理)能準確把握申請檔案的要點，以避免在申請過程中補正，達到節省人力與申請週期。軟體著作權登記前需要準備好相關的資料，具體有：軟體的源程式及文件;軟體的名稱及版本號、開發完成時間、發表時間;軟體執行環境(指軟體執行的硬體和軟體環境);軟體開發使用的程式設計語言的名稱及版本號、源程式總行數;軟體的主要功能、用途和技術特點作簡要說明。
根據基本資料準備申請檔案，向中國版權保護中心提交申請，同時要繳納申請費用。中國版權保護中心在收到相應的申請費後將於受理本次所申請軟體著作權登記。在受理後進入審查本次軟體著作權登記所提供的相關申請檔案，審查通過併發證。
總之，軟體著作權作為一種對自己軟體重點保護的依據，在法律上非常重要，一般，個人對軟體著作權上的問題經常出現一些法律上的糾紛，在申請過程中也會有很多的材料準備的問題。
