一、農村宅基地糾紛哪個部門管
如果是宅基地權屬糾紛，應該先到鄉鎮人民政府或縣級國土資源部門進行處理，對處理的決定不服經過行政複議後，方可行政訴訟，應到縣級人民法院。若是宅基地權屬清楚、可以直接向宅基地所在地的縣級人民法院提起訴訟。
鄉土地所/縣土地管理局/土地管理。我國的農村宅基由村上批，鄉里備案，如果宅基地發生糾紛由鄉級、縣級經管站負責仲裁。對仲裁不服的可以向基層人民法院提起民事訴訟。
二、涉及土地問題引起的糾紛應該如何處理呢?
1.首先你要證明這塊土地你有使用權，而證明的辦法只有一個，那就是土地權屬證明。因為土地是不動產，其權屬證明在我國是登記制，當事人必須持有土地權屬證明才能證明你對這塊土地有權利。頒發土地權屬證明是政府的權力，沒有取得這個證明前，是不能直接向人民法院起訴的。
2.如果雙方都有土地權屬證明，只是土地邊界有交叉、界限不明等引起的糾紛，應當先由政府確定邊界，這也是法律賦予政府的行政權力。
3.如果一方取得土地權屬證明後，另一方在其土地上放置雜物、建房等影響其正常使用的情況，這就是明顯的侵權行為了，協商不成時，就可以向人民法院起訴。
宅基地糾紛在農村很常見，有不少人認為只要有糾紛就去找法院，這是不對的，並不是什麼糾紛法院都有權處理。法院受理涉及土地及相鄰關係的民事案件範圍主要為侵權糾紛、排除妨礙糾紛、或者返還原物糾紛。《中華人民共和國土地管理法》第十六條第一款明確規定：土地所有權和使用權爭議，由當事人協商解決;協商不成的，由人民政府處理。如果只是土地使用權爭議，根據法律規定，法院無權處理。
宅基地案件按專屬管轄的原則應當由宅基地所在地法庭或法院受理。把握立案時的審查只是根據原告的訴稱作程式上的審查，並不做實體上的審查。經審查符合立案條件的立案受理，不符合條件的告知當事人到有管轄權的部門處理。堅持起訴的，裁定駁回起訴。
