雖然非法行醫罪和醫療事故罪都與疾病的診療活動有關，但二者的區別是顯著的，主要表現在以下方面：
1、主體不同
非法行醫罪的主體是沒有取得醫生從業資格的人。而醫療事故罪的主體，則是合法執業的醫護人員。
2、行為不同
非法行醫行為是不符合法律規定的。醫療事故罪的診療活動，是依法進行的。
3、結果不同
非法行醫只需要“情節嚴重”即可構成犯罪，而醫療事故罪的成立，需要達到“嚴重不負責任、造成就診人員死亡或者嚴重損害其身體健康”的程度;
4、主觀過錯內容不同
非法行醫罪主觀過錯為故意，醫療事故罪的主觀過錯為重大過失。
5、法定刑不同
非法行醫罪法定刑分為兩檔，最高刑可達10年。醫療事故罪法定刑只有一檔，並且最高刑只有3年。
法律依據：
《中華人民共和國刑法》第三百三十六條
【非法行醫罪】未取得醫生執業資格的人非法行醫，情節嚴重的，處三年以下有期徒刑、拘役或者管制，並處或者單處罰金;嚴重損害就診人身體健康的，處三年以上十年以下有期徒刑，並處罰金;造成就診人死亡的，處十年以上有期徒刑，並處罰金。
《中華人民共和國刑法》第三百三十五條
【醫療事故罪】醫務人員由於嚴重不負責任，造成就診人死亡或者嚴重損害就診人身體健康的，處三年以下有期徒刑或者拘役。
