1、概念上的區別
醫療事故是指醫療機構及其醫務人員在醫療活動中，違反醫療衛生管理法律、行政法規、部門規章和診療護理規範、常規，過失造成患者人身損害的事故。醫療過錯是指醫療事故以外，由於醫院的過錯，造成患者人身傷害的過錯。
2、醫療事故與醫療過錯在適用法律上存在差異，從而在鑑定、賠償數額等存在明顯不同
前者主要依據國務院頒佈的醫療事故處理條例，後者主要適用最高人民法院關於審理人身損害賠償。醫療事故的鑑定機構是醫學會，醫療過錯的鑑定機構是司法鑑定機構。按照醫療事故賠償所得要低於按照醫療過錯賠償所得。由於醫療事故鑑定被限定在糾紛醫院所在地的醫學會，鑑定的專家和糾紛涉及的醫院有千絲萬縷的聯絡，被認為是兄弟之間的鑑定，鑑定專家不需對鑑定結果承擔任何責任，所以其鑑定的公正性被廣泛質疑。醫療過錯的鑑定機關沒有地域限制，且鑑定人員為法醫，鑑定人員對鑑定結果負責，鑑定相對公正，曾經有統計，在不被鑑定為醫療事故的醫療侵權中，有70%以上被鑑定為醫療過錯。
之所以出現醫療事故與醫療過錯的區分，除了與目前法制現狀有關外，很重要的原因與目前醫療事故鑑定缺乏公正有直接的聯絡。由於醫療侵權的特殊性、複雜性，此二元制的現象將在很長一段時間持續存在。
3、關於醫療事故與醫療過錯的關係，人民法院在審理醫療糾紛案中應當處理好《民法典》與《醫療事故處理條例》之間的關係
對於鑑定機關認定不構成醫療事故，但在審理中有證據能夠認定醫療機構確實存在過錯，應當根據《民法典》關於過錯責任的認定，確定醫療機構應當承擔的責任。
4、醫療事故鑑定與司法鑑定的關係
在醫療事故糾紛處理過程中往往涉及多個鑑定，以至重複鑑定。對此，根據最高法院《關於參照〈醫療事故處理條例〉審理醫療糾紛民事案件的通知》的規定，在訴訟中，交由醫學會組織鑑定。對不構成醫療事故，當事人要求對醫療機構的過錯以及傷殘等級進行鑑定的，按照《人民法院對外委託司法鑑定管理規定》組織鑑定。
5、醫療糾紛中舉證責任倒置與正置的關係
最高法院《關於民事訴訟證據的若干規定》第4條中的規定是舉證責任的倒置，但只是部分舉證責任倒置，即涉及醫方是否有醫療過錯，醫療行為與損害結果之間是否存在因果關係負舉證責任。關於患者與醫療機構是否存在醫患法律關係，患方是否存在損害事實、是否存在實際損失、損失多少等，屬於舉證責任正置，舉證責任在患方。只有患者提供的證據達到《民訴法》第108條規定的起訴條件，人民法院才予立案受理。經過審理，只有患方對其負有舉證責任倒置才有意義。否則，應當依法駁回。
綜合上面所說的，醫療事故和醫療過錯兩種是屬於不同的性質，醫療事故發生一般是因過失而造成的犯罪;而對於醫療過錯就是由於醫院的過錯而造成他人的身體到傷害，這種行為嚴重者是會承擔刑事責任的，所以，不同的情形會做不同的處理。
