股權轉讓產生糾紛的，涉及以下幾種情形時，公司可以作為被告：
(一)股權轉讓雙方之間的糾紛
涉及到轉讓雙方之間的股權轉讓合同糾紛，如請求履行轉讓合同，請求支付股權轉讓款並賠償損失或支付違約金，或者請求解除轉讓合同，請求認定轉讓合同無效等等。這類糾紛主要適用民法典的有關規定進行處理，應列合同的相對人為被告，涉及到公司利益的，應列公司為第三人。
(二)涉及其他股東優先購買權的訴訟糾紛
這類糾紛需要結合公司法與民法典相關規定進行處理，應列出讓股權的股東為被告，公司為第三人，涉及其他的股東利益，一併追加為第三人。
(三)股權善意取得引發的糾紛案件
此類糾紛多產生於其他股東對於股權轉讓存在異議，一般是其他股東作為原告，而善意取得第三人與公司為被告。
(四)股權轉讓糾紛中涉及公司決議的糾紛案件
股權轉讓糾紛中涉及公司決議無效或撤銷，當事人起訴請求確認股東會或者股東大會、董事會決議無效或者請求撤銷上述決議的，應當列公司為被告，對決議涉及的相對利害關係人，可以列為共同被告或者第三人。
有限責任公司的股東之間可以相互轉讓其全部或者部分股權。
股東向股東以外的人轉讓股權，應當經其他股東過半數同意。股東應就其股權轉讓事項書面通知其他股東征求同意，其他股東自接到書面通知之日起滿三十日未答覆的，視為同意轉讓。其他股東半數以上不同意轉讓的，不同意的股東應當購買該轉讓的股權;不購買的，視為同意轉讓。
經股東同意轉讓的股權，在同等條件下，其他股東有優先購買權。兩個以上股東主張行使優先購買權的，協商確定各自的購買比例;協商不成的，按照轉讓時各自的出資比例行使優先購買權。
綜上所述，股權轉讓糾紛是可以將公司作為被告方的，但需要滿足一定的條件之後才可以將公司作為被告方，但若是公司的規章制度另有規定的話，那就按照公司的規章制度來進行履行，雙方的糾紛一般在被告方常駐的法院進行訴訟。
