保護隱名股東的權利方法：1.採用書面協議明確顯明股東和隱名投資者之間的權利義務關係。2.爭取與其他股東以及公司簽訂書面協議，明確各方對股權代持的知悉和同意。3.積極參與公司管理，充分行使股東權利。4.關注顯名股東持股情況，及時辦理股權變更登記。
法律依據：《公司法》
有限責任公司的股東之間可以相互轉讓其全部或者部分股權。
股東向股東以外的人轉讓股權，應當經其他股東過半數同意。股東應就其股權轉讓事項書面通知其他股東征求同意，其他股東自接到書面通知之日起滿三十日未答覆的，視為同意轉讓。其他股東半數以上不同意轉讓的，不同意的股東應當購買該轉讓的股權;不購買的，視為同意轉讓。
經股東同意轉讓的股權，在同等條件下，其他股東有優先購買權。兩個以上股東主張行使優先購買權的，協商確定各自的購買比例;協商不成的，按照轉讓時各自的出資比例行使優先購買權。
公司章程對股權轉讓另有規定的，從其規定。
