小產權房有房產證能否過戶，需要看具體的情況。如果房產證合法，買方有購買資格，雙方可以到發證機關諮詢能否辦理過戶。國家明令禁止小產權住房買賣，房管部門一般不會受理小產權住房過戶申請。
法律依據：《房屋登記辦法》第三十二條
發生下列情形之一的，當事人應當在有關法律檔案生效或者事實發生後申請房屋所有權轉移登記：
（一）買賣。
（二）互換。
（三）贈與。
（四）繼承、受遺贈。
（五）房屋分割、合併，導致所有權發生轉移的。
（六）以房屋出資入股。
（七）法人或者其他組織分立、合併，導致房屋所有權發生轉移的。
（八）法律、法規規定的其他情形。
