首先，依據智慧財產權法，及時取得相應的權利。
智慧財產權中除了著作權、制止不正當競爭權外，都不是自動產生的。專利權實行申請在先原則，而商標權採註冊確認和申請在先原則，企業只有及時申請並獲得授權或註冊，才能有效地保護自己的智慧財產權不受侵犯。
其次，健全內部智慧財產權規章制度，設立專門的智慧財產權管理機構。
企業內部健全的智慧財產權規章制度是十分重要的，一個企業的智慧財產權如技術祕密和商業祕密，若沒有健全的規章制度，極容易洩露，而一旦祕密公開，就得不到法律的保護，特別是在一些高新技術產業，因技術人員的流動帶走原單位的技術祕密和商業祕密，給這些企業帶來不可估量的損失，鑑於此，企業應建立以下智慧財產權規章制度：專利申報制度;專有技術申報制度;計算機軟體購銷審批制度;職工在工作中完成的智慧財產權的歸屬及獎勵辦法;職工應承擔的保護企業智慧財產權的義務，其中包括保護企業技術祕密、商業祕密不受侵犯的義務，以及洩露祕密應承擔的責任。
智慧財產權具有知識面廣、專業性強的特點，對智慧財產權的保護是一個長期而艱鉅的任務，關係到企業的發展乃至生存，因此，設立專門機構或專門管理人員十分必要。
再次，對侵犯智慧財產權的行為應採取果斷措施，維護自己的合法權益。
目前我國對智慧財產權保護實行“雙軌制”，即被侵權人可以向智慧財產權行政執法部門，如專利局、商標局、版權局投訴，請求對侵權行為進行查處，也可直接向人民法院起訴，但無論採取哪種途徑，企業在發現他人侵犯自己智慧財產權時，應及時收集證據。
最後，企業應對職工進行智慧財產權普法教育，將其作為新職工上崗前培訓的必修課。
智慧財產權雖然看似不存在，但卻能給企業帶來知名度、影響力，進而為企業帶來利潤，如果企業沒有很好的保護自己的智慧財產權就不得不以侵權事由來進行索賠。若企業不幸的走上破產道路之時，也不能忽視對智慧財產權的保護，因其依然能為企業帶來些許利益。
