如果對經營用的房屋進行拆遷的，並且房屋的產權是經營用的，拆遷時是有停產停業損失補償的。
對土地進行徵收時，徵收土地的補償包括土地補償費、安置補助費以及地上附著物和青苗的補償費。
農村房屋徵收的補償標準包括如下：
1、被徵收房屋價值的補償;
2、房屋徵收引起的搬遷，臨時安置補償;
3、補償因房屋徵收造成的停產停業損失。根據法律相關規定，徵地公告時，已取得建房批准檔案且新房已建造完畢的，對新房予以補償，對應當拆除而未拆除的舊房應予補償，個人的物權任何人不能侵犯，徵地公告時，已取得建房批准檔案但新房尚未建造完畢的，應當立即停止建房，具體補償金額可以協商議定。
(1)房屋價值補償標準
這裡的房屋補償，是指對被徵收的國有土地上建築物價值進行的補償，按不低於房屋徵收決定公告之日被徵收房屋類似的市場價格，並請有評估資質的評估機構進行評估確定。這裡的市場價格，地級市政府部門都會依據每年住宅房屋市場價格規律，制定出相應房屋市場價格表供當地被拆遷的居民進行參考。如：石家莊市人民政府針對三年大變樣政策，每年都出具了《石家莊拆遷區域住宅房屋市場價格表》。不清楚自己區域被拆遷房屋的價格的，可以找當地政府建設部門進行諮詢或索取材料。對評估確定房屋價值有異議的，可以向複核評估，對複核結果有異議的，可以向評估專家委員會申請再次鑑定。
(2)搬遷費和臨時安置費(俗稱過渡費)
搬遷費和臨時安置費用，具體數額各市一般都已確定具體數額及計算方式，詳見各地出具標準，在這裡作者所列算的補償標準，是以大眾化被拆遷人自主搬遷和過渡方式進行的計算。如果拆遷人提供週轉房，則無需支付臨時安置費。以石家莊為例(自主搬遷)：2012年搬遷費20元/平方米，按2次計算;臨時安置費(過渡費)按25元/平方米計算，逾期12月以內，每月增加50%，預期12個月不滿24個月的，自第13個月起每月增加75%，逾期24個月以上的，自第25個月起每月增加100%。(具體以當地政府政策為準)
(3)停產停業損失的補償
該費用針對非住宅類房屋運營性房屋進行補償，因為屬個案，補償標準不能統一，一般是有徵收當事人進行協商確定，協商不成的，可委託房地產價格評估機構評估確定。
(4)補助和獎勵
補助包括困難補助和公攤補助。困難補助是針對貧困人員進行的補助，依據當地政府出具的標準確定;公攤補助針對所有被拆遷人的房屋公攤進行的額外補助，也會出具公攤補助標準。
在司法實踐中，對於徵地補償的專案和標準應當由政府部門來制訂，對於徵地行為的確定應當由政府處理，其它個人或者單位都是無權進行認定的，具體情況下應當結合實際情況來處理，避免在法律適用的過程中，因補償標準不合理而導致矛盾。
需要注意的是，在我國的土地徵收的補償的規定中，如果是用作經營性質的房屋、土地被徵收的，此時在行政機關對該房屋或者是土地徵收的時候，是需要對其停產停業的損失予以補償的，如果是不補償的，此時被徵收人是可以通過申請行政複議和行政訴訟來維權的。
