1、發包方拖欠工程款違約糾紛這種違約糾紛的特點是，工程款是可以確定的，故這種糾紛法律比較簡單。這類糾紛形成的主要原因發包方沒有任何正當理由違約拖欠，主要表現為的發包方無力支付工程款;發包方有支付能力無故拖欠工程款。
2、關於總包、分包問題引起的工程款糾紛，這種糾紛法律關係較為複雜。這種糾紛主要表現為承包方分包在程式上有瑕疵，發包方事後不予承認分包合同的合法性，從而引起的糾紛。
3、竣工結算報告爭議引發的工程款糾紛這種糾紛主要表現為：承包方製作結算檔案遞交發包方，未取得遞交結算檔案的證據，發包方不予答覆且事後不承認收到;承包方製作結算檔案遞交發包方，發包方不予答覆;承包方製作結算檔案遞交發包方，發包方不予認可而引發的工程款結算糾紛。
4、建築材料品質之爭引起的工程款糾紛這種表現糾紛主要表現為：建設工程招投標時對工程主要建築材料品質有所要求或承諾，但由於建築材料市場供求關係的影響，有時使得承包方轉而採用合同外的其他建材，引起結算糾紛。
5、質保金糾紛該類糾紛主要表現為建設工程竣工後出現維修事項，承包人在保修期內履行了維修義務但無法直接取得證據，發包方事後不予承認維修事實以承包方未盡保修義務為由拒不支付工程款引發了糾紛。
6、合同瑕疵引發的工程款糾紛合同瑕疵引發的工程款糾紛主要表現為：承包人未取得建築施工企業資質或者超越資質等級的、沒有資質的實際施工人借用有資質的建築施工企業名義的建設工程施工合同引發合同無效糾紛。
