本罪與非罪的界限:構成本罪，必須是引起甲類傳染病傳播或者有傳播的嚴重危險的行為。因此，認定本罪應當與一般違法行為區別開來。一般違法行為沒有造成甲類傳染病傳播的結果，也不可能有甲類傳染病傳播的嚴重危險。對有違反傳染病防治規定的一般行為，應由縣級以上政府衛生行政部門責令限期改正，可以處以罰款;有造成傳染病流行危險的，由衛生行政部門報請同級政府採取強制措施。
法律依據：《中華人民共和國刑法》
第三百三十條 【妨害傳染病防治罪】違反傳染病防治法的規定，有下列情形之一，引起甲類傳染病以及依法確定採取甲類傳染病預防、控制措施的傳染病傳播或者有傳播嚴重危險的，處三年以下有期徒刑或者拘役；後果特別嚴重的，處三年以上七年以下有期徒刑：
（二）拒絕按照疾病預防控制機構提出的衛生要求，對傳染病病原體汙染的汙水、汙物、場所和物品進行消毒處理的；
（三）准許或者縱容傳染病病人、病原攜帶者和疑似傳染病病人從事國務院衛生行政部門規定禁止從事的易使該傳染病擴散的工作的；
（四）出售、運輸疫區中被傳染病病原體汙染或者可能被傳染病病原體汙染的物品，未進行消毒處理的；
（五）拒絕執行縣級以上人民政府、疾病預防控制機構依照傳染病防治法提出的預防、控制措施的 [14] 。
單位犯前款罪的，對單位判處罰金，並對其直接負責的主管人員和其他直接責任人員，依照前款的規定處罰。
甲類傳染病的範圍，依照《中華人民共和國傳染病防治法》和國務院有關規定確定。
