工程重大安全事故罪的立案標準如下：
建設單位、設計單位、施工單位、工程監理單位違反國家規定，降低工程質量標準，涉嫌下列情形之一的，應予立案追訴：
(一)造成死亡一人以上，或者重傷三人以上;
(二)造成直接經濟損失五十萬元以上的;
(三)其他造成嚴重後果的情形。
法律依據：
《中華人民共和國刑法》第一百三十五條 【重大勞動安全事故罪】安全生產設施或者安全生產條件不符合國家規定，因而發生重大傷亡事故或者造成其他嚴重後果的，對直接負責的主管人員和其他直接責任人員，處三年以下有期徒刑或者拘役;情節特別惡劣的，處三年以上七年以下有期徒刑。
《中華人民共和國刑法》第一百三十五條 之一【大型群眾性活動重大安全事故罪】舉辦大型群眾性活動違反安全管理規定，因而發生重大傷亡事故或者造成其他嚴重後果的，對直接負責的主管人員和其他直接責任人員，處三年以下有期徒刑或者拘役;情節特別惡劣的，處三年以上七年以下有期徒刑。
