1、侵犯的客體和物件不同。挪用資金罪侵犯的客體是公司、企業或者其他單位的資金的使用權，物件是公司、企業或者其他單位的資金;職務侵佔罪侵犯的客體是公司、企業或者其他單位的資金的所有權，物件是公司、企業或者其他單位的財物，既包括貨幣形態的資金和有價證券等，也包括實物形態的公司財產，如物資、裝置等。
2、客觀表現不同。挪用資金罪表現為公司、企業或者其他單位的工作人員，利用職務上的便利，挪用本單位資金歸個人使用或者借貸給他人，數額較大、超過3個月未還的，或者雖未超過3個月，但數額較大、進行營利活動的，或者進行非法活動的行為;職務侵佔罪表現為，公司、企業或者其他單位的人員，利用職務上的便利，將本單位財物非法佔為己有，數額較大的行為。
3、主觀上不同。挪用資金罪行為人的目的在於非法取得本單位資金的使用權，但並不企圖永久非法佔有，而是準備用後歸還;職務侵佔罪的行為人的目的在於非法取得本單位財物的所有權，而並非暫時使用。
法律依據《中華人民共和國刑法》。
