在治療工傷期間發生了醫療事故的，需要先去進行醫療事故等級的鑑定，根據醫療工作人員的過失行為在事故中對患者所造成的損害後果及程度和工傷與醫療事故造成的損害之間的關係密切程度來綜合判斷醫療機構的賠償責任，按照正常的醫療事故賠償程式進行賠償。
法律依據：《醫療事故處理條例》
第四十九條
醫療事故賠償，應當考慮下列因素，確定具體賠償數額：
（一）醫療事故等級；
（二）醫療過失行為在醫療事故損害後果中的責任程度；
（三）醫療事故損害後果與患者原有疾病狀況之間的關係。不屬於醫療事故的，醫療機構不承擔賠償責任。
