二者的區別在於資產重組後原企業的資產和負債只是進行重新劃分和組合，還屬於原企業，所有權未發生轉移；而企業合併後，原企業的資產和負責都轉讓給合併企業了，所有權發生了轉移。
資產重組是指企業資產的擁有者、控制者與企業外部的經濟主體進行的，對企業資產的分佈狀態進行重新組合、調整、配置的過程，或對設在企業資產上的權利進行重新配置的過程。
企業重組，是對企業的資金、資產、勞動力、技術、管理等要素進行重新配置，構建新的生產經營模式，使企業在變化中保持競爭優勢的過程。企業重組貫穿於企業發展的每一個階段。企業重組是針對企業產權關係和其他債務、資產、管理結構所展開的企業的改組、整頓與整合的過程，以此從整體上和戰略上改善企業經營管理狀況，強化企業在市場上的競爭能力，推進企業創新。
法律依據：《上市公司重大資產重組管理辦法》 第十條
上市公司實施重大資產重組，應當符合下列要求：
（一）符合國家產業政策和有關環境保護、土地管理、反壟斷等法律和行政法規的規定；
（二）不會導致上市公司不符合股票上市條件；
（三）重大資產重組所涉及的資產定價公允，不存在損害上市公司和股東合法權益的情形；
（四）重大資產重組所涉及的資產權屬清晰，資產過戶或者轉移不存在法律障礙，相關債權債務處理合法；
（五）有利於上市公司增強持續經營能力，不存在可能導致上市公司重組後主要資產為現金或者無具體經營業務的情形；
（六）有利於上市公司在業務、資產、財務、人員、機構等方面與實際控制人及其關聯人保持獨立，符合中國證監會關於上市公司獨立性的相關規定；
（七）有利於上市公司形成或者保持健全有效的法人治理結構。
