（一）區分破壞本罪與破壞交通設施罪、破壞易燃易爆裝置罪、破壞廣播電視、公用電信設施罪的界限
他們在犯罪的主體、物件、犯罪的手段、犯罪的故意等方面有相同之處。其主要區別在於：
(1)本罪屬於危害軍事利益的犯罪，而後幾種罪是危害公共安全的犯罪；
(2)本罪破壞的物件只限於軍事設施，而後幾種罪破壞的物件不限於軍事設施。因此，凡是行為人，故意破壞軍事設施，即使客觀上也危害公共安全，仍應以破壞軍事設施罪論處。
（二）本罪與故意毀壞財物罪的界限
本罪是一種比故意毀壞公私財物罪的危害大得多的犯罪。它的嚴重性不僅僅在於被破壞的武器裝備、軍事設施、軍事通訊的財產價值，而是在於這種破壞行為能夠使武器裝備喪失其應有的效能，從而嚴重影響我軍的戰備和戰鬥能力。
主要區別：
(1)侵犯的客體不同。本罪侵犯的客體是與武器裝備的使用能力相聯絡的軍事利益，而後者侵犯的客體是公私財物的所有權；
(2)本罪破壞的是特定物件，即武器裝備、軍事設施、軍事通訊，後者破壞的物件，是各種公私財物。據此，非軍職人員破壞武器裝備、軍事設施、軍事通訊以外的一般財物，如生活用品、辦公裝置等，或者破壞武器裝備、軍事設施、軍事通訊的區域性，並不影響其使用的，應依故意毀壞財物論處。
（三）因盜竊而引起破壞武器裝備、軍事設施、軍事通訊的行為的定性
當前，因盜竊財物造成武器裝備、軍事設施、軍事通訊被破壞的現象比較普遍，這類犯罪屬於牽連犯。在認定時，首先要根據因盜竊所破壞的武器裝備、軍事設施、軍事通訊的重要程度、犯罪情節、所盜物品的價值，分別確定破壞武器裝備、軍事設施、軍事通訊罪與盜竊罪應當適用的法定刑，然後按照重罪吸收輕罪的原則定罪處罰。
（四）用放火、爆炸等危險方法破壞武器裝備、軍事設施、軍事通訊的行為的定性
用放火、爆炸等危險方法破壞武器裝備、軍事設施、軍事通訊，屬於牽連犯，應按照重罪吸收輕罪的原則，以放火罪、爆炸罪定罪處罰。
