土地確權糾紛由誰處理

個人之間、個人與單位之間、單位與單位之間發生的爭議案件，由爭議土地所在地的縣級國土資源行政主管部門調查處理。個人之間、個人與單位之間發生的爭議案件，可以根據當事人的申請，由鄉級人民政府受理和處理。
設區的市、自治州國土資源行政主管部門調查處理跨縣級行政區域的、同級人民政府、上級國土資源行政主管部門交辦或者有關部門轉送的爭議案件。

法律依據：土地權屬爭議調查處理辦法 第五條

 個人之間、個人與單位、單位與單位之間發生的爭議案件，由爭議土地所在地的縣級國土資源行政主管部門調查處理。前款規定的個人之間、個人與單位、單位與單位之間發生的爭議案件，可以根據當事人的申請，由鄉級人民政府受理和處理。