根據《土地管理法》第四十五條規定，徵收下列土地的，由國務院批准：(一)基本農田。也就是說只要徵收基本農田都要由國務院批准。只有國務院批准後，市、縣人民政府才能組織實施。
因此只要耕地劃入基本農田保護區，按照法律規定就應該嚴格保護。除法律規定的國家能源、交通、水利、軍事設施等國家重點建設專案選址無法避開外，其他任何建設專案都不得佔用。城市建設要跳出已劃定的基本農田，實現組團式、串聯式發展，不得侵佔基本農田建新區，也不能以各種園區、開發區名義非法圈地、佔用基本農田。
對於老百姓在明確自己的承包地屬於基本農田，而且地方政府沒有取得國務院徵地批文的情況下實施的違法徵地，可以向法院提起行政訴訟和向上級政府提起行政複議，也可以舉報和申請上級國土部門、監察機關的查處，並對行政機關負責人實施追責，來維護自己的合法權益。
法律依據：《土地管理法》第四十五條
徵收下列土地的，由國務院批准：
(一) 基本農田;
(二) 基本農田以外的耕地超過三十五公頃的;
(三) 其他土地超過七十公頃的。
徵收前款規定以外的土地的，由省、自治區、直轄市人民政府批准，並報國務院備案。
徵收農用地的，應當依照本法第四十四條的規定先行辦理農用地轉用審批。其中，經國務院批准農用地轉用的，同時辦理徵地審批手續，不再另行辦理徵地審批;經省、自治區、直轄市人民政府在徵地批准許可權內批准農用地轉用的，同時辦理徵地審批手續，不再另行辦理徵地審批，超過徵地批准許可權的，應當依照本條第一款的規定另行辦理徵地審批。
總的來說，徵收基本農田的批准機關最高權力機構可以說是國務院，最低權力機構是省級人民政府，一定要做好徵地相關準備工作，如果不想被欺騙，必須及時瞭解相關程式和相關法律。
