1、兩層樓的房屋被拆遷補償金的計算方式為，房屋價值的補償，加上搬遷費，再加上安置費等的補償費用。
根據《國有土地上房屋徵收與補償條例》第十七條
作出房屋徵收決定的市、縣級人民政府對被徵收人給予的補償包括：
(一)被徵收房屋價值的補償;
(二)因徵收房屋造成的搬遷、臨時安置的補償;
(三)因徵收房屋造成的停產停業損失的補償。
市、縣級人民政府應當制定補助和獎勵辦法，對被徵收人給予補助和獎勵。
2、關於2層樓補償面積的計算方法，現在應該是有兩種可以參考。
一種是按照實際面積的50%去計算。還有一種則是按照價格去計算也就是指拆遷補償的價格來計算，然而拆遷補償價格是按照基準地價乘以補償係數，再乘以基礎房價得出來的。因為每一個地方的補償情況都不太相同，因為他們的開發目標都不一樣，有可能是直接補償面積，也有可能是直接補償錢，這個都是不太好説的，具體要以當地的政策來計算才準確一些。
二、房屋拆遷一定可以獲得補償嗎?
1、房屋拆遷不一定可以獲得補償。
市、縣級人民政府及其有關部門應當依法加強對建設活動的監督管理，對違反城鄉規劃進行建設的，依法予以處理。
市、縣級人民政府作出房屋徵收決定前，應當組織有關部門依法對徵收範圍內未經登記的建築進行調查、認定和處理。對認定為合法建築和未超過批准期限的臨時建築的，應當給予補償;對認定為違法建築和超過批准期限的臨時建築的，不予補償。
2、一般情形下房屋被拆遷有補償
(1)房屋補償費，以被拆遷房屋的結構和折舊程度劃檔，按平方米單價計算;
(2)週轉補償費，以臨時居住條件劃檔，按被拆遷房屋住户的人口每月予以補貼;
(3)獎勵性補償費，由當地人民政府根據本地的實際情況和國家有關法律政策加以確定，拆建單位必須嚴格執行、不得任意更改。
一般情形下，不管被拆遷的房屋是一層樓，還是兩層樓，只要房屋屬於合法建築，那麼拆遷方就需要向被拆遷方支付一定數額的補償金。對於被拆遷方來説，需要與拆遷方協商確定具體的補償數額，對於無法協商達成一致的，則由政府部門作出補償決定。
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