醫療糾紛是指發生在醫療衛生、預防保健、醫學美容等具有合法資質的醫療企事業法人或機構中，一方(或多方)當事人認為另一方(或多方)當事人在提供醫療服務或履行法定義務和約定義務時存在過失，造成實際損害後果，應當承擔違約責任或侵權責任，但雙方(或多方)當事人對所爭議事實認識不同、相互爭執、各執己見的情形。
1、排除了對責任人的追究。由於和解無須、甚至也無法嚴格堅持法律規則，和解把糾紛主體的意志置於判斷糾紛主體行為合法性以及處置糾紛權益關係的法律規則之上。因此，儘管和解可以消除糾紛，但其卻也常常排斥了本應介入的公權力機關對相關責任人的追究。這一問題在醫療事故和解中表現得尤為明顯。由於醫療事故往往存在民事責任、行政責任和刑事責任的競合，在發生競合情況下，當事人間的和解可能就排斥了衛生行政部門和檢察機關對相關主體的責任追究，從而使責任人逃避法律制裁。實踐中，限制這種消極影響的辦法是為通過和解解決醫療糾紛劃定恰當的適用範圍，規定屬於行政機關和檢察機關職權範圍內的事項不適用和解。
2、通過和解解決醫療糾紛的侷限性還表現在其他方面：
(1)運作中的隨意性使得人們對和解的公平性、合法性信心不足。
(2)和解協議效力不足也容易導致更大的風險和重複成本。
因此，在通過和解解決醫療糾紛的時候，應一方面鼓勵醫療糾紛當事人採用要式和解協議，並通過公證或擔保等形式以加強和解協議的法律效力;另一方面應協調和解和其他醫療糾紛解決方式之間的銜接，一旦和解破裂就及時通過其他糾紛解決方式解決醫療糾紛。
