1、辦理進出口貨物退(免)稅認定：出口企業在辦理《對外貿易經營者備案登記表》後30日內、或者未取得 進出口 經營權的生產企業代理出口在發生首筆出口業務之日起30日內，必須到所在地主管退稅的稅務機關辦理出口貨物退(免)稅認定手續，納入進出口退稅管理。
2、進出口企業在退(免)稅申報時必須使用國稅局進出口退稅申報軟體。
3、確認進出口銷售收入
出口企業應在貨物實際報關出口，取得提單並向銀行辦妥交單手續時，確認銷售收入的實現，生產企業應同時在當期的 增值稅納稅申報表上反映免抵退出口收入。出口企業必須到當地徵稅機關領取《江蘇省淮安市出口商品專用 發票 (出口專用)》，作為入帳和申報的正式憑證。
4、進出口退(免)稅申報
(一)外貿企業退(免)稅申報
發票認證：取得增值稅專用發票後30日之內必須到當地主管徵稅稅務機關進行認證;
申報期限：單證齊全後即可在申報系統中進行退稅申報，每月可分批多次申報;
(二)生產企業退(免)稅申報，免稅申報：
1)已進行免抵退認定的生產企業，在進行增值稅納稅申報之前，還須用免抵退申報系統進行免稅出口明細申報，將生成的免稅資料匯入增值稅納稅申報系統。如果企業當月無出口收入，須進行免稅“零申報”，操作時不需進行免稅資料錄入，直接生成電子資料(空檔案);新辦企業進行第一次免稅申報時，“ 進料加工 抵扣明細表”中資料都錄入“0”。
2)免抵退資料匯入後，還須在當月的增值稅納稅申報表上進行反映。其中“出口銷售額”，對應增值稅納稅申報表上第7欄“免抵退 辦法 出口貨物銷售額”;如果出口的產品徵 稅率 與退 稅率 之間有差額，則在增值稅納稅申報表上除了反映出口銷售額外，還須同時反映“ 免抵退稅 辦法 出口貨物不得抵扣進項稅額”，對應增值稅納稅申報表附列資料。
單證齊全後在退稅申報系統中生成電子資料並進行退稅申報，申報期限為每月15日前。
5、領取退稅審批通知單
一般情況下，生產企業可在退稅申報的次月初，到徵收大廳退稅視窗領取“生產企業出口貨物 免抵退稅 審批 通知 單”，並根據通知單內容，做好相關帳務處理。
首次辦理進出口退稅的建議還是先到稅務局去諮詢一下，進出口退稅的操作相對來說比較複雜，退稅申報可以在當月分多次進行申報，一般都是在網上稅務局進行申報的。
