印花稅有兩種徵收方式，分別是查賬徵收和核定徵收。
一、印花稅的徵收方式是查賬徵收的。
查賬徵收即企業按照實際簽訂、領受、適用的應稅憑證數量和金額申報印花稅即可。
購銷合同印花稅稅率：根據《中華人民共和國印花稅暫行條例》的規定：購銷合同包括供應、預購、採購、購銷結合及協作、調劑、補償、易貨等合同，稅率是按購銷金額萬分之三貼花繳納印花稅。
二、印花稅的徵收方式是核定徵收的。
《國家稅務總局關於進一步加強印花稅徵收管理有關問題的通知》(國稅函[2004]150號)規定，根據《稅收徵管法》第三十五條規定和印花稅的稅源特徵，為加強印花稅徵收管理，納稅人有下列情形的，地方稅務機關可以核定納稅人印花稅計稅依據：
(一)未按規定建立印花稅應稅憑證登記簿，或未如實登記和完整儲存應稅憑證的;
(二)拒不提供應稅憑證或不如實提供應稅憑證致使計稅依據明顯偏低的;
(三)採用按期彙總繳納辦法的，未按地方稅務機關規定的期限報送彙總繳納印花稅情況報告，經地方稅務機關責令限期報告，逾期仍不報告的或者地方稅務機關在檢查中發現納稅人有未按規定彙總繳納印花稅情況的。地方稅務機關核定徵收印花稅，應向納稅人發放核定徵收印花稅通知書，註明核定徵收的計稅依據和規定的稅款繳納期限。
所以如果企業是查賬徵收的方式，則其購銷合同印花稅都是按月繳納，繳納金額為合同金額的萬分之三。如果企業是核定徵收的方式，則其購銷合同印花稅按照銷售收入、購進金額之和，乘上一個行業簽約比率，來核定印花稅的計稅依據。因此企業在繳納印花稅時應注意區分不同徵收方式的印花稅，避免因徵收方式不同而導致印花稅錯繳或漏繳。
