一、增值稅專用發票認證後作廢怎麼辦？
由受票方（認證發票方）向主管稅務局說明情況，填報《開具紅字增值稅專用發票申請單》。稅務局稽核後，出具《開具紅字增值稅專用發票通知單》。受票方將其中聯次交給開票方，開票方憑此《通知單》開具負數發票（紅字）衝減當期銷售。購買方還要依《通知單》所列增值稅稅額從當期進項稅額中轉出，未抵扣增值稅進項稅額的可列入當期進項稅額，待取得銷售方開具的紅字專用發票後，與留存的《通知單》一併作為記賬憑證。
二、增值稅專用發票認證期限是多久？
從發票開具來看，增值稅一般納稅人可以自行開具增值稅專用發票和增值稅普通發票、增值稅電子普通發票；而增值稅小規模納稅人只能自行開具增值稅普通發票、增值稅電子普通發票，若對方需要增值稅專用發票，需要向稅務機關申請代開；其他納稅人如自然人，同樣只能通過代開方式開具增值稅專用發票和增值稅普通發票。從受票方來說，增值稅專用發票只能開具給除自然人外的增值稅納稅人，而增值稅普通發票可以開具給所有的受票物件。
增值稅專用發票認證是指通過增值稅發票稅控系統對增值稅發票所包含的資料進行識別、確認。一般情況下，採用一般計稅方法的增值稅一般納稅人取得增值稅專用發票以後，需在180日內進行認證，並在認證通過的次月按照增值稅有關規定據以抵扣增值稅進項稅額。增值稅一般納稅人取得增值稅普通發票，不得進行進項抵扣。而增值稅小規模納稅人沒有進項抵扣的概念，所以也不需要取得增值稅專用發票和進行認證工作。
三、現在採用哪種認證方式的比較多？
現在一般是採用網上認證的方式。增值稅專用發票網上認證是指納稅人通過使用增值稅專用發票抵扣聯掃描採集系統進行發票掃描或企業電子報稅管理系統手工錄入發票資訊，採集並生成加密格式的待認證檔案，然後通過網上認證系統傳輸到稅務機關，由稅務機關完成解密、認證。
綜上所述，為了避免因開錯發票而影響到企業抵扣稅費，增值稅專用發票認證後作廢也是可以的，需要受票方開具紅字發票予以對衝。儘管政策規定是這樣，但是財務人員還是應該拿到發票後和實際發生的貿易往來進行認真核對，如果發現發票有問題，及時向出票方反映，而不是等待認證後才發現，那麼比較麻煩。
