一、補充協議與原合同衝突怎麼辦
補充協議是對原合同的補充或者變更，一般要明確約定，如果補充協議條款與原合同不一致或發生衝突時，應當以補充協議為準。
簽訂合同之後，發現內容還需補充的，可以擬定合同補充協議。合同補充協議的擬定需要注意幾個資訊：
一是雙方當事人的基本資訊需全面具體;
二是說明擬定補充協議的原因;
三是協議補充的內容或變更的內容。
當補充合同的約定與主合同的約定發生矛盾時，應該以時間在後的約定條款為準執行。所以，補充合同的效力優於主合同的效力。時間在後的約定，實際上是對主合同的原約定的重新修訂，該新約定是補充合同的精要和實質。如果仍以主合同的原條款為準執行，那就失去了補充合同存在的意義。
二、補充協議怎麼寫才有效
補充協議的成立生效與主合同成立生效的依據相同，補充協議有效須具備形式要件和實質要件。
實質要件包括三個方面：
①主體合格。即當事人應具備相應的民事行為能力。
②當事人意思表示真實。
③不違反法律行政法規強制性規定，不損害社會公共利益，不違背公序良俗。
形式要件包括兩個方面：
①法律、行政法規規定採用書面形式的，應當採用書面形式;
②當事人約定採用書面形式的，應當採用書面形式。
相關法律規定：
《民法典》第五百一十條
合同生效後，當事人就質量、價款或者報酬、履行地點等內容沒有約定或者約定不明確的，可以協議補充;不能達成補充協議的，按照合同有關條款或者交易習慣確定。
第五百四十三條 當事人協商一致，可以變更合同。
法律、行政法規規定變更合同應當辦理批准、登記等手續的，依照其規定。
第五百四十四條 當事人對合同變更的內容約定不明確的，推定為未變更。
