可以，分公司可以獨立開發票，如果和總公司同在一個縣（市）的，由總公司一起向稅務機關進行報備。但是分公司不具有法人資格，其民事責任由公司承擔。
《中華人民共和國增值稅暫行條例》 第二十二條 增值稅納稅地點：
（一）固定業戶應當向其機構所在地的主管稅務機關申報納稅。總機構和分支機構不在同一縣（市）的，應當分別向各自所在地的主管稅務機關申報納稅；經國務院財政、稅務主管部門或者其授權的財政、稅務機關批准，可以由總機構彙總向總機構所在地的主管稅務機關申報納稅。
（二）固定業戶到外縣（市）銷售貨物或者勞務，應當向其機構所在地的主管稅務機關報告外出經營事項，並向其機構所在地的主管稅務機關申報納稅；未報告的，應當向銷售地或者勞務發生地的主管稅務機關申報納稅；未向銷售地或者勞務發生地的主管稅務機關申報納稅的，由其機構所在地的主管稅務機關補徵稅款。
（三）非固定業戶銷售貨物或者勞務，應當向銷售地或者勞務發生地的主管稅務機關申報納稅；未向銷售地或者勞務發生地的主管稅務機關申報納稅的，由其機構所在地或者居住地的主管稅務機關補徵稅款。
（四）進口貨物，應當向報關地海關申報納稅。 扣繳義務人應當向其機構所在地或者居住地的主管稅務機關申報繳納其扣繳的稅款。
《中華人民共和國公司法》 第十四條 公司可以設立分公司。設立分公司，應當向公司登記機關申請登記，領取營業執照。分公司不具有法人資格，其民事責任由公司承擔。 公司可以設立子公司，子公司具有法人資格，依法獨立承擔民事責任。
