總公司在分公司有股份佔比嗎

沒有。分公司沒有股東，分公司的營業執照上只有負責人。分公司歸屬總公司管理，在業務、資金、人事等方面受總公司管理，不具有法人資格。分公司在法律、經濟上沒有獨立性，屬於總公司的附屬機構。
按照《公司法》的規定，有限責任公司或股份有限公司設立的分公司不具有企業法人資格，其民事責任由總公司承擔。