按照我國《民事訴訟法》的規定，合同糾紛，由被告住所地或合同履行地人民法院管轄。如果合同沒有實際履行，雙方住所地又都不在合同約定的履行地的，應由被告住所地人民法院管轄。同時，法律賦予當事人協議約定管轄法院的權利，即合同的雙方當事人可以在書面合同中協議選擇被告住所地、合同履行地、合同簽訂地、原告住所地、標的物所在地人民法院管轄，但不得違反民訴法對級別管轄和專屬管轄的規定。在股權轉讓協議糾紛中，如果雙方當事人對管轄法院有約定且約定有效的，應適用其約定；沒有約定或約定不明，應適用法律規定，即由被告住所地或合同履行地人民法院管轄。對於股權轉讓的合同履行地，應為股權轉讓的目標公司的公司註冊地。因為，公司股權轉讓糾紛的特殊性在於轉讓行為需要向公司註冊地的登記機關履行相應手續方可完成，因此，以公司註冊地作為此類案件的管轄地也是國際上通行的做法。
《中華人民共和國民事訴訟法》
第二十三條因合同糾紛提起的訴訟，由被告住所地或者合同履行地人民法院管轄。
第二十一條對公民提起的民事訴訟，由被告住所地人民法院管轄；被告住所地與經常居住地不一致的，由經常居住地人民法院管轄。對法人或者其他組織提起的民事訴訟，由被告住所地人民法院管轄。同一訴訟的幾個被告住所地、經常居住地在兩個以上人民法院轄區的，各該人民法院都有管轄權。
