如果公司是增值稅納稅人，那就需要補稅，因為庫存商品的進項稅是已經被抵扣了的。
提供的檔案僅只企業從一般納稅人登出成為小規模納稅人的情況，並不是整個企業都登出。
根據《財政部 國家稅務總局關於增值稅若干政策的通知》（財稅〔2005〕165號）第六條規定，一般納稅人登出或被取消輔導期一般納稅人資格，
轉為小規模納稅人時，其存貨不作進項稅額轉出處理，其留抵稅額也不予以退稅。因此，一般納稅人辦理登出時，庫存未實現銷售不需要補繳增值稅。
一般納稅人企業申請登出稅務登記時，如果企業銷項稅金大於進項稅金，並且按登出企業的有關政策規定交納增值稅後，企業還有存貨餘額的，其存貨餘額部分應按存貨的適用稅率計算補交已抵扣的稅款，
因為存貨在當初購進時其進項稅金已作了抵扣，減少了當期應交稅金，既然現存貨已經退出了企業的經營活動，所以要對先期已抵扣的進項稅進行調整。
法律依據：
《財政部 國家稅務總局關於增值稅若干政策的通知》（財稅〔2005〕165號）
一般納稅人登出時存貨及留抵稅額處理問題：
一般納稅人登出或被取消輔導期一般納稅人資格，轉為小規模納稅人時，其存貨不作進項稅額轉出處理，其留抵稅額也不予以退稅。
